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9. Sida et lentiviraux. Avec quels lentivirus? Avec quels résultats? Etudiants: Adan Villamarin, Julien Graber ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------2/2 A. les mots-clés sont riches et pertinents 0/2 B. La grammaire des équations correspondant aux mots-clés est fausse. Les équations n'ont pas été comprises.
1/2 C. Outils: Plusieurs outils ont été explorés, encyclopédies online, site de compagnie, google, pubmed, web of science. sites vulgarisés science.com. Des résultats de recherche ont pu être trouvés grâce à des mots-clés corrects, mais il est impossible de reproduire la recherche documentaire à partir des équations suggérées dans les outils, car elles sont fausses. Les équations ont été reconstituées à partir des références trouvées, et non l'inverse, on dirait... 2/2 D. Les références bibliographiques sont correctes, et mentionnent l'outil qui les a trouvé 2/2 E. Les éléments de réponse à la question contient des affirmations correctement référencées 1/2 F. On a de bons éléments de démarche méthodologique d'information, mais en raison le lecteur ne parvient pas à reproduire les recherches, car les équations restituées dans inutilisables.Les éléments de réponse à la question sont bien cachés dans des copiés-collés immenses... vous pourriez être plus bref, pour qu'on puisse d'un coup voir avec quel antivirus on peut traiter le sida? Pour information, on peut utiliser des textes intégraux avec guillemets et source, ou des idées empruntées avec paraphrase et source (droit d'auteur). Mais la reproduction par copié collé d'image, de tableau, de dessin, de graphique, de statistiques, n'est pas possible, même en citant la source! Pour une reproduction, il faut demander aux auteurs et à l'éditeur la permission de reproduction (droit de diffusiont). Parfois, il faut payer pour obtenir ce droit. Autrement dit, le droit d'utilisation des "images" n'est pas le même que les idées sous forme écrite! 8/12 pts --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- DefinitionsAIDS "Acquired immune deficiency syndrome (AIDS) is an infectious disease caused by the human immunodeficiency virus (HIV). It was first recognized in the United States in 1981. AIDS is the advanced form of infection with the HIV virus, which may not cause recognizable disease for a long period after the initial exposure (latency). No vaccine is currently available to prevent HIV infection. At present, all forms of AIDS therapy are focused on improving the quality and length of life for AIDS patients by slowing or halting the replication of the virus and treating or preventing infections and cancers that take advantage of a person's weakened immune system."
Gale Encyclopedia of Medicine. The free dictionnary[en ligne]. Disponible sur: <http://medical-dictionary.thefreedictionary.com/AIDS>. (consulté le 31.10.08) Find with Library EPFL, encyclopédies
HIV "A transmissible retrovirus that causes AIDS in humans. Two forms of HIV are now recognized: HIV-1, which causes most cases of AIDS in Europe, North and South America, and most parts of Africa; and HIV-2, which is chiefly found in West African patients. HIV-2, discovered in 1986, appears to be less virulent than HIV-1, but also may have a longer latency period." Gale Encyclopedia of Medicine. The free dictionnary[en ligne]. Disponible sur: < http://medical-dictionary.thefreedictionary.com/human+immunodeficiency+virus>, (consulté le 05.11.08). Find with Library EPFL, encyclopédies Human Immunodeficiency Virus (HIV) H & DI. Health and Development Initiative[en ligne], disponible sur:<http://www.healthinitiative.org/HTML/hiv/firstcontact/hivbig.htm>.(consulté le 05.11.08) Find on Google Image Lentiviral
"A genus of retroviruses that cause persistent infection that typically results in chronic, progressive, usually fatal disease; it includes the human immunodeficiency viruses."
Dorland's Medical Dictionary for Health Consumers., the free dictionnary[en ligne]. Disponible sur: <http://medical-dictionary.thefreedictionary.com/lentiviral>. (consulté le 31.10.08) Find with Library EPFL, encyclopédies
Lentiriral Vector
VRX496: is derived from HIV-1 and carries, rather than disease components, a payload that efficently inhibits HIV replication to prevent disease, according to Virxsys company. The payload is a VRX496 Antisens RNA. The usage of lentivirus instead of retroviruses is in part explained by the fact that lentiviruses tend not to integrate into oncogene promoters and to cause Cancer. HIV based lentiviruses are also well known regarding their replication cycle and structure, what ensure better safety and prediction of the behavior of the lentivirus. "The advantages of using HIV-1-based vectors over other vector types for HIV/AIDS gene therapy are: they can transduce primary CD4+ T lymphocytes with very high stable efficiency, the anti-HIV effect is a combination of the anti-HIV antisense payload and competition by cis-acting elements in the HIV-1 vector (e.g. ψ, TAR and RRE decoys) with wt- HIV for factors for replication and encapsidation, and by flanking the anti-HIV antisense with HIV sequences in the vector’s backbone, vector anti-HIV antisense RNAs are effectively targeted to the intracellular site of wt-HIV RNA accumulation, hence mediating their effective destruction."[3]
Results Researchers found that an HIV-based lentiviral vector was a safe and potentially effective way to deliver an anti-HIV gene when in phase I clinical trials. The Scientist. The Scientist.com: magazine of the life sciences every day, online [en ligne]. Disponible sur: <http://www.the-scientist.com/news/home/33781/>, (consulté le 04.11.08)
TABLE 1
Company - Future
 Virxsys is a private biotech company that is developing a gene delivery system for the treatment of severe diseases like HIV/AIDS. Their first application of gene therapy technology, named VRX496, treats this disease. The company is taking a safe step-wise approach to reaching efficacy in its HIV/AIDS program.
The safety of lentiviral vectors over pre-existing retroviral vectors has been well recognized in the scientific and FDA community [1,2,3]. The “next steps” to improving the therapeutic index will use the methods of multiple dosing, and conditioning, both of which have also been previously shown to be safe in Phase I clinical trials[1]. They are currently in Phase II clinical trials. VIRxSYS Company, VIRxSYS[en ligne]. Disponible <http://www.virxsys.com/>. (consulté le 04.11.08 et le 10.11.08) Find with Google
Penser au pluriel, aux adjectifs, aux noms, à l'anglais, au français Mots clés: SIDA, AIDS, HIV, HIV-1, lentivirus, lentiviral, lentiviraux, lentivir*, retrovirus, retroviral, retroviraux, retrovir*, immunodeficiency, immunodeficience, immunotherapy, immuno*, treatment, therapy, gene therapy, vect*, virus. Mots supplémetaires: human, company, virxsys, clinical, trial(s), phase(s), fight, corporation(s), safety, NIH, FDA.
9.2 Equations testées dans quel outil de recherche documentaire (Penser aux e-books, catalogue NEBIS, bases de données multidisciplinaires, bases de données spécialisées, google, google scholar, forum, personne ressources, catalogues d'autres bibliothèques)
Encyclopédies Equation: <AIDS OR HIV OR lentiv*> Databases ISI web of knowledge Equation: < "lentiviral HIV" > <(HIV OR AIDS) AND immunotherapy> je ne comprends pas ce que sont ces < >, qui n'existent pas en syntaxe de recherche documentaire? Est-ce que ce sont 2 équations séparées ou une, comme le suggère le singulier Equation? Google Equations: < AIDS AND/OR lentivir* AND/OR therapy > < (AIDS OR HIV) AND "to fight AIDS" > <HIV-1 AND lentivir*> AND/OR: une interface de recherche d'un moteur ou BDB ne peut pas comprendre ça. PubMed Equations: < HIV (AND/OR) lentiviral AND therapy > < HIV AND/OR "lentiviral therapy" > < human AND/OR immunodeficiency OR/AND virus > NEBIS (recherche par mots) Equation: <HIV-1 AND (AIDS OR "to fight AIDS")> <lentivirus AND HIV-1> les mots-clés sont tout à fait inadéquats pour trouver des livres avec cette (ces?) équation(s). ll faudrait avoir des mots-clés dans des domaines, et pas aussi spécifiques que suggérés, qui seraient bons pour remonter à des articles très spécialisés. Exemple: lentivir* AND ( aids OR hiv ) = 14 résultats
La plupart des informations que nous avons trouvé, proviennent du site Web de la Compagnie Virxsys. Beaucoup de liens sur des articles écrits par leurs propres collaborateurs sont présents et conseillés. Dû à la relative "jeunesse" du sujet, nous n'avons pas trouver beaucoup de livres capables de répondre aux questions posées. Par contre, un bon nombre d'articles scientifiques ont été trouvés sur PubMed.
[1] Bruce L. Levine, Laurent M. Humeau, Jean Boyer, Rob-Roy MacGregor, Tessio Rebello, Xiaobin Lu, Gwendolyn K. Binder, Vladimir Slepushkin, Franck Lemiale, John R. Mascola, Frederic D. Bushman, Boro Dropulic and Carl H. June. Gene transfer in humans using a conditionally replicating lentiviral vector. Proc Natl Acad Sci U S A. 2006 Nov 14;103(46):17372-7. Epub 2006 Nov 7 Find on PubMed [2] Humeau LM, Binder GK, Lu X, Slepushkin V, Merling R, Echeagaray P, Pereira M, Slepushkina T, Barnett S, Dropulic LK, Carroll R, Levine BL, June CH, Dropulic B. Efficient lentiviral vector-mediated control of HIV-1 replication in CD4 lymphocytes from diverse HIV+ infected patients grouped according to CD4 count and viral load. Mol Ther. 2004 Jun;9(6):902-13. Find on PubMed [3] Lu X, Humeau L, Slepushkin V, Binder G, Yu Q, Slepushkina T, Chen Z, Merling R, Davis B, Chang YN, Dropulic B. Safe two-plasmid production for the first clinical lentivirus vector that achieves >99% transduction in primary cells using a one-step protocol. J Gene Med. 2004 Sep;6(9):963-73. Find on PubMed [4] Schonely K, Afable C, Slepushkin V, Lu X, Andre K, Boehmer J, Bengston K, Doub M, Cohen R, Berlinger D, Slepushkina T, Chen Z, Li Y, Binder G, Davis B, Humeau L, Dropulic B. QC release testing of an HIV-1 based lentiviral vector lot and transduced cellular product. 2003. Bioproc. J. 2: 39-47. Find on PubMed [5] Slepushkin V, Chang N, Cohen R, Gan Y, Jiang B, Deausen E, Berlinger D, Binder G, Andre K, Humeau L, Dropulic B. Large-scale purification of a lentiviral vector by size exclusion chromatography or mustang Q ion exchange capsule. 2003. Bioprocessing J. 2: 89-95. Find with PubMed [6] Melissa Lee Phillips. Lentiviral vectors appear safe for gene therapy. The Scientist [en ligne]. 7th November 2006. Disponible sur <http://www.the-scientist.com/news/home/33781/>. (consulté le 05.11.08) Find with PubMed [7] Maggie Fox, Health and Science Editor. U.S. experiment uses AIDS to fight AIDS. REUTERS AlertNet [en ligne]. 06 Nov 2006. Disponible sur <http://www.alertnet.org/thenews/newsdesk/N06300058.htm>. (consulté le 05.11.08) Find with Google [8] DE BORO Dropulic and BARRIE Carter. Concepts in Genetic Medicine. John Wiley & Sons, 2008. (ISBN 0471703206, 9780471703204) Find on NEBIS
Attention: à la fin d'une référence, mentionnez l'outils de recherche qui l'a trouvé!)
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